Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms