Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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