Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms