Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP1Q9UPQ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP1Q9UPQ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms