Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms