Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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USP18Q9UMW8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP18Q9UMW8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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USP18Q9UMW8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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USP18Q9UMW8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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USP18Q9UMW8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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USP18Q9UMW8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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USP18Q9UMW8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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USP18Q9UMW8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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USP18Q9UMW8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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