Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms