Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CIZ1Q9ULV3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms