Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV0

MYO5B, Unconventional myosin-Vb, humanhuman

Predictions only

Length 1,848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5BQ9ULV0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO5BQ9ULV0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO5BQ9ULV0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms