Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA2Q9UL42 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms