Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms