Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PACSIN3Q9UKS6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms