Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms