Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GGA1Q9UJY5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms