Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms