Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms