Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms