Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA4Q9UI42 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA4Q9UI42 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms