Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CC2D2AQ9P2K1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CC2D2AQ9P2K1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CC2D2AQ9P2K1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms