Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NINJ2Q9NZG7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NINJ2Q9NZG7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms