Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BSDC1Q9NW68 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms