Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCLQ9NW38 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms