Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASF1BQ9NVP2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms