Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LMBRD1Q9NUN5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMBRD1Q9NUN5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms