Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDREJQ9NTG1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms