Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms