Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP2Q9NS61 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms