Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC1Q9NRX5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms