Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPHNQ9NQX3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPHNQ9NQX3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms