Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASS4Q9NQ75 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms