Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC52A3Q9NQ40 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms