Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEMA4BQ9NPR2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms