Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VAT1LQ9HCJ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms