Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6CQ9HCJ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6CQ9HCJ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms