Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SHARPINQ9H0F6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHARPINQ9H0F6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms