Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM8Q9BZR9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms