Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIFKQ9BYG3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms