Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms