Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC4A5Q9BY07 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC4A5Q9BY07 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC4A5Q9BY07 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC4A5Q9BY07 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms