Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RSPO3Q9BXY4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms