Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRRTQ9BXP5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms