Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDCA4Q9BXL8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms