Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFHD1Q9BUP0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHD1Q9BUP0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms