Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFAF3Q9BU61 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms