Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT17Q9BSW7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT17Q9BSW7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms