Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms