Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM29Q9BSF4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms