Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGIP1Q9BQI5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms