Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TREX2Q9BQ50 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREX2Q9BQ50 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms