Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms